碱基分为胞嘧啶（缩写作C）、鸟嘌呤（G）、腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（TDNA专有）和尿嘧啶（U，RNA专有）五种5种碱基中，腺嘌呤和鸟嘌呤属于嘌呤族（缩写作R）它们具有双環结构。胞嘧啶、尿嘧啶、胸腺嘧啶属于嘧啶族（Y）它们的环系是一个六元杂环。
RNA中尿嘧啶取代了胸腺嘧啶的位置，值得注意的是胸腺嘧啶比尿嘧啶多一个5位甲基，这个甲基增大了遗传的准确性碱基通过共价键与核糖或脱氧核糖的1位碳原子相连而形成的化合物叫核苷。核苷再与磷酸结合就形成核苷酸磷酸基接在五碳糖的5位碳原子上。
DNA(脱氧核糖核酸碱基)的结构出奇的简单DNA分子由两条很长的糖链结構构成骨架，通过碱基对结合在一起就象梯子一样。
整个分子环绕自身中轴形成一个双螺旋两条链的空间是一定的，为2nm在形成稳定螺旋结构的碱基对***有4种不同碱基。嘌呤和嘧啶都有酮-烯醇式互变异构现象一般生理pH条件下呈酮式。 AGCT（U）四种碱基在DNA中的排列遵循碱基互补配对原则
碱基还构成一些生命必须物质或是重要的辅酶如ATP,GTP,CoA等，对生命活动的作用非常大