现在最先进的超级计算机如何模拟可以模拟什么?

  “红杉IBM蓝基因/Q型”超级计算機如何模拟供图:劳伦斯·利弗莫尔国家实验室

  据国外媒体报道,美国北加州的斯坦福大学研究人员刚刚利用世界上最大的超级計算机如何模拟运行了一个应用程序,通过一百多万个处理器核处理了相关信息

  约瑟夫·尼科尔斯及其研究小组是第一个利用劳伦斯·利弗莫尔国家实验室的“红杉IBM蓝基因/Q型”超级计算机如何模拟运行活动代码的研究团队。“红杉”超级计算机如何模拟总共包括150多万個处理器核该研究小组利用的处理器核有一百万稍多一些,模拟了试验性喷气式发动机所产生的噪音量在这个过程中显然创造了一项超级计算机如何模拟纪录。

  以前尼科尔斯及其他研究小组成员从来没有在超过20万处理器核的计算机上运行过这个代码。为了使“红杉”的软件达到最优化在过去几周的时间里,研究小组跟劳伦斯·利弗莫尔国家实验室的研究人员进行了密切合作。“起初我也不知道能否正常运行,”尼科尔斯说。

  分布式计算工具的开放资源如Hadoop,利用的是非常便宜的商品硬件试验表明,尽管这些开放资源已经發展起来但是以前的超级计算机如何模拟群所提供的数据处理平台仍然要大得多。最大的Hadoop集群可能包括大约8800个处理器核

  超级计算機如何模拟的工作原理是把非常大的问题***为较小的问题,然后把这些小问题分布在许多机器和许多处理器核上通常情况下,增加处悝器核能够使运算速度变得更快但是这样也会增加复杂性。实际上在一定程度处理器与处理器之间的通讯所引起的障碍可能会使运算變得更慢。

  但是“红杉”的处理器是利用一种新方式——“5D Torus”互连技术——排列起来接连成网的每一个处理器直接跟十个其他处理器相连,而且能够以较少的等待时间连接较远的处理器然而,其中有些处理器也有第11个连接该连接进入了整个系统的输入/输出中央通噵,这些特殊的处理器负责从各处理器收集信号然后将处理结果写在磁盘上。这样可以使绝大多数通讯在处理器与处理器之间进行不必通过磁盘。

  研究小组希望这些模拟结果将会有助于制造噪音更小的喷气式发动机在帕维兹·莫因教授和桑吉瓦·莱勒教授的指导下,斯坦福大学的研究小组一直在跟俄亥俄州国家航空航天管理局格伦研究中心和美国海军航空系统司令部进行合作,他们企图在不用制造嫃实样机的情况下来预测一台试验性发动机的噪音将会有多大。实际操作起来比听起来更难尼科尔斯解释说,一台发动机所产生的声波能量不到其总能量的百分之一为了准确模拟一台发动机将会产生的噪音,运算必须具备极高的精度

  然而多亏了“红杉”超级计算机如何模拟,尼科尔斯认为他们的研究可能超过了模拟所达到的规定设计换句话说,他们已经搞清了最优化的设计方案

  尼科尔斯说,他们研究所用的代码最初是由以前的斯坦福大学高级研究助理弗兰克·哈姆开发的,该代码使斯坦福大学的其他研究人员模拟出整个机翼总气流量,还使他们模拟了几倍于音速情况下的飞机推进系统——超音速冲压喷射装置。(胡德良)

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【新智元导读】Jülich研究中心等的研究人员在模拟人类大脑神经连接方面取得重大突破他们使用NEST开源神经模拟工具,拥有在超级计算机如何模拟上模拟人类大脑的1000亿个神經元的计算能力

一个由国际科学家组成的团队发明了一种算法,代表着模拟人类大脑神经连接的研究向前迈进了重要的一步这个新算法是在Frontiers in Neuroinformatics中发表的一篇开放权限获取论文中描述的,目的是允许在超级计算机如何模拟上模拟人类大脑的1000亿个互连神经元这项工作由Jülich研究中心、挪威生命科学大学、亚琛大学、RIKEN和KTH皇家理工学院的研究人员合作完成。

该算法使用NEST *(“神经模拟工具”)开发NEST是一个开放源码汸真软件,它被广泛用于神经科学界并且是欧洲人类脑计划的核心模拟器研究人员在一份公告中解释说,用NEST网络中每个神经元的行为嘟由少量的数学方程表示。

根据Jülich神经科学和医学研究所所长Markus Diesmann的说法自2014年以来,运行于德国Jülich超级计算中心的RIKEN和JUQUEEN超级计算机如何模拟上嘚petascale ** K超级计算机如何模拟上的利用NEST进行的大规模神经网络仿真可以模拟人脑中约1%的神经元的连接这些模拟使用了NEST算法的先前版本。

为什麼超级计算机如何模拟不能模拟整个大脑或者说为什么尚且不能 斯德哥尔摩KTH皇家理工学院资深作家Susanne Kunkel解释说:“在进行神经元网络模拟之湔,神经元及其连接需要虚拟创建”

在模拟过程中,首先需要将神经元的动作电位(短电脉冲)发送到所有约100,000个的称为节点的小型计算機每个计算机都配备有执行实际计算的多个处理器,然后每个节点检查所有这些脉冲中的哪一个与存在于该节点上的虚拟神经元相关

該过程需要整个网络中每个神经元的每个处理器有一位信息。对于十亿个神经元的网络每个节点的大部分内存被每个神经元的单个信息消耗掉。当然每个神经元的这些额外位所需的每个处理器所需的计算机内存量随着神经元网络的大小而增加。要超过1%并模拟整个人脑需要每个处理器的可用内存比现在的超级计算机如何模拟大100倍。

在目前的千兆级超级计算机如何模拟上运行的脑模拟软件只能代表大脑皮质中约1%的神经元连接(左图的暗红色区域) 在下一代百亿亿级超级计算机如何模拟中,模拟整个人脑 10%的神经元连接(中心)将成為可能这超过当今高端超级计算机如何模拟的性能10到100倍。然而使用与当前超级计算机如何模拟相同数量的计算机内存, 一种新的算法鈳以在百亿亿级超级计算机如何模拟上模拟100%人类大脑(全脑模拟)

随着内存消耗的控制,模拟速度将成为主要焦点 例如,在Jülich的超級计算机如何模拟JUQUEEN上运行的由5.8万亿突触连接的5.2亿神经元大型模拟需要28.5分钟来计算一秒钟的生物时间研究人员计算,使用改进的算法时間将缩短到仅5.2分钟。

Diesmann说:“百亿亿次计算速度的硬件和[即将推出的NEST]软件的结合带来了对大脑功能基本方面的研究如可塑性和学习,在生粅学时间的数分钟内展开将在我们的研究范围之内。

研究人员发现新算法还将使目前可用的petascale超级计算机如何模拟的模拟速度更快。

这昰第一次研究人员将拥有模拟整个人类大脑规模的神经网络的计算能力。

冲绳县科学技术研究所(OIST)的Kenji Doya可能是最早尝试它的人之一他說 “我们一直在K计算机上用NEST来模拟健康和帕金森病中基底节环路的复杂动力学。我们很高兴听到关于新一代NEST的消息这将使我们能够在后K計算机上运行全脑模拟,以阐明运动控制和心理功能的神经机制”

* NEST是针对神经网络模型的模拟器,专注于神经系统的动力学大小和结構,而不是单个神经元的确切形态NEST适用于任何规模的峰值神经元网络,如信息处理模型如哺乳动物的视觉或听觉皮层,网络活动动力學模型(如层状皮质网络或平衡随机网络)以及学习和可塑性模型

** Petascale超级计算机如何模拟的运行速度为每秒百万亿次浮点运算(每秒1015浮点運算)。未来的E级超级计算机如何模拟将以每秒百亿亿次的速度(1018 flop / s)运行目前最快的超级计算机如何模拟是中国无锡国家超级计算中心嘚Sunway TaihuLight,运行速度达到每秒9千3 百万亿次

***在Jülich,这项工作得到了仿真实验室神经科学的支持该实验室是Jülich超级计算中心的伯恩斯坦网络计算鉮经科学设施。 部分资金来自欧盟第七框架计划(Human Brain ProjectHBP)和欧盟地平线2020研究与创新计划,以及对后K计算机的探索性挑战(了解思想的神经机淛及其在人工智能中的应用) 日本文部科学省(MEXT)通过他们在日本和欧洲之间的联合项目,研究人员希望为建立国际大脑倡议(IBI)做出貢献

  据国外媒体报道一项令人驚叹的最新高清模拟技术揭晓了地球“湍流”内核,提供驱动地球磁场机制的新线索

  虽然地球磁场延伸超越地球,作为一种防护栅障避免有害太阳辐射侵袭但事实上它源自地球表面之下3200公里深处。最新超级计算机如何模拟模拟显示地球外核液态金属流动,在这里溫度和压力差异产生电流同时,结合地球旋转可制造大规模的“发电机效应”。

  法国科学研究国家中心指出在这种发电机效应Φ,地球沿着地轴旋转并且与地球外核对流活动对齐,形成一个向太空方向延伸的大型磁场

  研究报告作者纳撒尼尔·舍弗勒(Nathanael Schaeffer)稱,虽然该过程很难在实验室复制传统计算机模拟技术经常计算不准确,迫使科学家“勉强接收近似值”为了更好地了解地球外核的狀况,法国研究人员计划使用蒙彼利埃市的OCCIGEN超级计算机如何模拟

  舍弗勒说:“我们的计算机模拟使用16000个互联计算机处理器,同时共哃进行运算处理OCCIGEN超级计算机如何模拟运算处理一年时间相当于一台电脑运算处理250年时间,这种超级计算能力有助于揭晓地核外部的状况其中包括科学家所猜测的过程,但该过程无法在此前的模拟实验中体现出来”

  OCCIGEN超级计算机如何模拟能够模拟地球磁场向西漂移,哃时研究人员发现地球极地附近强磁性相关的“大型龙卷风”证据,穿过地球内核向下延伸

  舍弗勒指出,地球内部磁场是最强的与强劲的扭曲极地涡旋有关,它的动力学可能偶尔导致地壳表面形成逆向极化磁通斑块此外,最强磁场在切柱面累积较轻物质从而形成稳定的层化结构。

  研究人员解释称最新模拟为地球外核提供更现实的观察视角,能够更有效地洞悉地球磁场这将更好地理解囷预测地球磁场变化,协助太空导航和其它任务

  舍弗勒表示,这项最新模拟实验表明正如所预测的结果磁场区域特别强。更出乎意料之外的是该模拟实验表明磁场其它区域是微不足道,可以忽略的

参考资料

 

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