唯一的差别就是御三家方面DP版初始御三家为小火猴,圆企鹅以及嫩苗龟;BW版的御三家为暖暖猪水水濑以及藤藤蛇。
DP版可以获得除BW御三家以外的所有精灵(包括神兽)BW则鈳以获得除DP御三家以外的所有精灵(包括神兽)。即使是通过联机传送DP和BW的专属御三家也无法进入到另一版本,最多产生问号精灵